Mein Lieber, ich kann dir da etwas helfen.
Wenn du auswanderst, gibt es für GmbH Inhaber Wegzugsbesteuerung. Alle mit über 1% Anteil werden besteuert. Das ganze ist ziemlich verrückt, weil der Staat annimmt, du würdest die GmbH verkaufen und diese fiktiven Einnahmen (Gewinne mal 13,75x) besteuert. Das ganze wird hier erklärt:
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Man kann das ganze wohl legal umgehen, aber ganz günstig (oder einfach) wird es nicht. Denn dazu brauchst du eine "doppelte Holding" und außerdem müssen gewisse andere Aktivitäten stimmen (z.B. wirtschaftliche Aktivität in einer der anderen Gesellschaften). Hier helfen spezialisierte Anwälte für Internationales Steuerrecht. Ein normaler Steuerberater hat meist keine oder kaum echte Ahnung.
Nimmst du diese Lösung und bekommst NHR Status, zahlst du vermutlich weiterhin einfach 25% Kapitalertragssteuer auf Dividenten in DE und nichts in PT.
Du könntest theoretisch die GmbH auch an deine Eltern verschenken, die sie später an dich zurückerben, nur kommst du dann nicht mehr mit 25% Steuer an das Geld aus der GmbH ran. Dividenten gehen dann nicht, denn du besitzt ja nicht. Zudem müssten deine Eltern bei über 20k GmbH Schenkungssteuer zahlen.
Gehalt als Freelancer von der Gmbh ginge, aber du zahlst dann höchstwahrscheinlich hohe portugisische Einkommenssteuern und fällst nicht unter NHR (nochmal mit portugisischem NHR Anwalt klären).
Im Endeffekt würde ich dir empfehlen mit spezialisierten Anwälten für Internationales Steuerrecht zu reden und dich über die Doppelte Holding zu informieren. Rede mit mehr als 1 Anwalt, denn die Meinungen weichen gerne mal voneinander ab.
Ich hoffe das hilft dir etwas weiter.